まずapt-getで入れて、その後、公式からダウンロード、
kdesu dolphinで/usr/share/arduino/にコピー(上書き)。
その後、エディタの汚いのを以下に合わせて修正。
Arduino IDE のインストールと使い方 (Linux編):息子と一緒に Makers:So-netブログ http://makers-with-myson.blog.so-net.ne.jp/2013-10-27
kdesuが使えない問題は、以下のページを参考に。
Debian User Forums • View topic - HOWTO - get kdesu back to normal in KDE4
http://forums.debian.net/viewtopic.php?f=16&t=40158
色々書いているが、
su
ln -s /usr/lib/kde4/libexec/kdesu /usr/bin/kdesu
exit
でOK。